KEGGREST

DOI:10.18129 / B9.bioc.KEGGREST

这是发展KEGGREST版本;稳定版请参见KEGGREST．

京都基因和基因组百科全书(KEGG)的客户端REST访问

Bioconductor版本:开发(3.16)

为京都基因和基因组百科全书(KEGG) REST服务器提供客户端接口的包。基于J. Zhang, R. Gentleman和Marc Carlson的KEGGSOAP，以及Aurelien Mazurie的KEGG (python包)。

作者:Dan Tenenbaum [aut]， Jeremy Volkening [ctb]， Bioconductor Package Maintainer [aut, cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("KEGGREST")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“KEGGREST”)

超文本标记语言	R脚本	访问KEGG REST API
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，KEGG，通路，软件，ThirdPartyClient
版本	1.37.3
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(9.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	方法,httr，png，Biostrings
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，knitr，减价
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	Hiiragi2013，ROntoTools
进口我	亚当，adSplit，AnnotationDbi，吸引，BiocSet，ChIPpeakAnno，cn，EnrichmentBrowser，famat，小伙子，计，KEGGlincs，MetaboSignal，MWASTools，NoRCE，PADOG，pairkat，pathview，RnaSeqSampleSize，SBGNview，击杀，transomics2cytoscape，YAPSA
建议我	类别，categoryCompare，GenomicRanges，globaltest，iSEEu，中长期规划，莲花，RTopper
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	KEGGREST_1.37.3.tar.gz
Windows二进制	KEGGREST_1.37.3.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	KEGGREST_1.37.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGREST
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/KEGGREST
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/KEGGREST/
软件包下载报告	下载数据