PADOG

DOI:10.18129 / B9.bioc.PADOG

这是发展PADOG版本;稳定发布版本请参见PADOG．

重叠基因权重降低的途径分析(PADOG)

Bioconductor版本:开发(3.16)

这个软件包实现了一种称为PADOG的通用基因集分析方法，它淡化了经常出现在要分析的基因集中的基因的重要性。在使用KEGGdzPathwaysGEO软件包中的24个公共数据集的敏感性和排序方面，该软件包也为基因集分析方法提供了一个基准。

作者:Adi Laurentiu Tarca ;辉徐<辉。徐:gmail.com >

维护人员:Adi L. Tarca

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("PADOG")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“PADOG”)

PDF	R脚本	PADOG
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，软件，TwoChannel
版本	1.39.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (R-2.15)(10年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.0.0),KEGGdzPathwaysGEO、方法、Biobase
进口	limma，AnnotationDbi，GSA，foreach，doRNG，hgu133plus2.db，hgu133a.db，KEGGREST，nlme
链接
建议	doParallel、并行
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	BLMA
进口我	EGSEA
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	PADOG_1.39.0.tar.gz
Windows二进制	PADOG_1.39.0.zip
macOS二进制(x86_64)	PADOG_1.39.0.tgz
macOS二进制(arm64)	PADOG_1.39.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PADOG
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PADOG
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/PADOG/
包下载报告	下载数据