BiocSet

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocSet

这是发展BiocSet版本;稳定的发布版本请参见BiocSet．

代表不同的生物集合

生物导体版本:开发(3.14)

BiocSet显示不同的生物集在三咬舌格式。这三个字母分别是' element '， ' set '和' elementset '。用户可以激活这三个tibit中的一个来执行dplyr包中的常用功能。BiocSet还提供了元素/集合的映射功能和web参考。

作者:Kayla Morrell, Martin Morgan, Kevin Rue-Albrecht, Lluís Revilla Sancho [ctb]

维护者:凯拉·莫雷尔<凯拉。莫雷尔在roswellpark.org >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("BiocSet")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BiocSet”)

超文本标记语言	R脚本	BiocSet:在Tidyverse中表示元素集
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	去，GeneExpression，KEGG，软件
版本	1.7.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6),dplyr
进口	方法,宠物猫跑龙套,rlang，plyr，S4Vectors，BiocIO，AnnotationDbi，KEGGREST，ontologyIndex，tidyr
链接
建议	GSEABase、气道、org.Hs.eg.dbDESeq2，limma，BiocFileCacheGO.db,testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	RegEnrich
进口我
建议我	dearseq
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	BiocSet_1.7.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	BiocSet_1.7.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocSet
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocSet
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BiocSet/
包下载报告	下载数据