CNER

doi：10.18129/b9.bioc.cner

这是发展CNER的版本；对于稳定版本，请参阅CNER。

CNE检测和可视化

生物导体版本：开发（3.16）

对保守非编码元素集的大规模识别和高级可视化。

作者：ge tan

维护者：ge tan

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ cner”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ CNER”）

html	R脚本	CNE识别和可视化
html	R脚本	成对整个基因组比对
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	DataImport，，，，结肠管制，，，，软件，，，，可视化
版本	1.33.0
在生物导体中	Bioc 2.14（R-3.1）（8年）
执照	GPL-2 |文件执照
要看	R（> = 3.5.0）
进口	生物弦（> = 2.33.4），DBI（> = 0.7），rsqlite（> = 0.11.4），GenomeInfodB（> = 1.1.3），基因组机（> = 1.23.16），rtracklayer（> = 1.25.5），xvector（> = 0.5.4），基因组签名（> = 1.1.9），方法，S4VECTORS（> = 0.13.13），iranges（> = 2.5.27），readr（> = 0.2.2），生物基因，工具，并行，RESHAPE2（> = 1.4.1），GGPLOT2（> = 2.1.0），PowerLaw（> = 0.60.3），注释（> = 1.50.0），go.db（> = 3.3.0），r.utils（> = 2.3.0），keggrest（> = 1.14.0）
链接	S4VECTORS，，，，iranges，，，，xvector
建议	GVIZ（> = 1.7.4），生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，BSGENOME.DRERIO.UCSC.DANRER10，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38，，，，txdb.drerio.ucsc.danrer10.refgene，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.ggallus.ucsc.galgal3
系统要求
增强
URL	https://github.com/ge11232002/cner
BugReports	https://github.com/ge11232002/cner/issues
取决于我
进口我	TFBSTOOLS
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	cner_1.33.0.tar.gz
Windows二进制	cner_1.33.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	cner_1.33.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cner
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/cner
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/cner/
软件包下载报告	下载统计