kegglincs

doi：10.18129/b9.bioc.kegglincs

这是发展Kegglincs的版本；对于稳定版本，请参阅kegglincs。

可视化kegg途径中的所有边缘和覆盖lincs数据

生物导体版本：开发（3.16）

通过从KGML文件获得的信息中明确创建路径映射，查看KEGG路径的“引擎盖下方”的情况。

作者：Shana White

维护者：shana White ，Mario Meddedovic

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ keggglincs”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ kegglincs”）

html	R脚本	kegglincs工作流程
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	细胞生物学，，，，datarepresentation，，，，基因表达，，，，GraphandNetwork，，，，kegg，，，，网络，，，，网络引导，，，，途径，，，，软件，，，，第三派对人
版本	1.23.0
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（5。5年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.3），科达塔，hgu133a.db，org.hs.eg.db（> = 3.3.0）
进口	AnnotationDbi，，，，kegggraph，，，，Igraph，，，，plyr，，，，gtools，，，，httr，，，，rjsonio，，，，keggrest，方法，图形，统计，utils，XML，grdevices
链接
建议	生物管理器（> = 1.20.3），尼特，，，，图形
系统要求	Cytoscape（> = 3.3.0），Java（> = 8）
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	kegglincs_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	kegglincs_1.23.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	kegglincs_1.23.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/kegglincs
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/kegglincs
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/kegglincs/
软件包下载报告	下载统计