这是发展Fella的版本;对于稳定版本,请参阅小伙子。
生物导体版本:开发(3.16)
使用KEGG条目丰富代谢组学数据。给定一组受影响的化合物,Fella建议使用知识模型网络中使用标签传播的影响反应,酶,模块和途径。可以看到和导出所得的子网。
作者:Sergio Picart-Armada [AUT,CRE],Francesc Fernandez-Albert [aut],Alexandre Perera-llluna [aut]
维护者:sergio picart-armada
引用(从r内,输入引用(“ Fella”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ fella”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Fella”)
R脚本 | 示例:脂肪肝脏研究 | |
R脚本 | 示例:镀金头式oxybenzone博览会 | |
R脚本 | 小伙子 | |
html | R脚本 | 快速开始 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 去,,,,GraphandNetwork,,,,kegg,,,,代谢组学,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,软件 |
版本 | 1.17.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(4年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 3.5.0) |
进口 | 方法,Igraph,,,,矩阵,,,,keggrest,,,,plyr,统计,图形,utils |
链接 | |
建议 | 闪亮的,,,,DT,,,,马格里特,,,,Visnetwork,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,Biomart,org.hs.eg.db,org.mm.eg.db,AnnotationDbi,,,,Gosemsim |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Fella_1.17.0.tar.gz |
Windows二进制 | fella_1.17.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fella |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/伙伴 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/fella/ |
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