小伙子

doi:10.18129/b9.bioc.fella

这是发展Fella的版本;对于稳定版本,请参阅小伙子

代谢组学数据的解释和富集

生物导体版本:开发(3.16)

使用KEGG条目丰富代谢组学数据。给定一组受影响的化合物,Fella建议使用知识模型网络中使用标签传播的影响反应,酶,模块和途径。可以看到和导出所得的子网。

作者:Sergio Picart-Armada [AUT,CRE],Francesc Fernandez-Albert [aut],Alexandre Perera-llluna [aut]

维护者:sergio picart-armada

引用(从r内,输入引用(“ Fella”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ fella”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Fella”)

PDF R脚本 示例:脂肪肝脏研究
PDF R脚本 示例:镀金头式oxybenzone博览会
PDF R脚本 小伙子
html R脚本 快速开始
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 ,,,,GraphandNetwork,,,,kegg,,,,代谢组学,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,软件
版本 1.17.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(4年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.5.0)
进口 方法,Igraph,,,,矩阵,,,,keggrest,,,,plyr,统计,图形,utils
链接
建议 闪亮的,,,,DT,,,,马格里特,,,,Visnetwork,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,Biomart,org.hs.eg.db,org.mm.eg.db,AnnotationDbi,,,,Gosemsim
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Fella_1.17.0.tar.gz
Windows二进制 fella_1.17.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fella
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/伙伴
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/fella/
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