BIOC 2.6发布
BIOC 2.6发布Bioconduct者2.6由389个包装组成，旨在与R版本2.11一起使用，于2010年4月23日发布。
我们很高兴地宣布释放Biocumon 2.6。此版本包括37个新软件包，以及对现有软件包的许多更改。Biocumon 2.6由389个软件包组成，与最近发布的R 2.11.0兼容。
Linux，32位Windows，Mac OS X 10.5（Leopard）和Mac OS X 10.6（Snow Leopard）支持Biocumon 2.6。Biocumon 2.6还具有实验的64位窗口，用于其大部分包装。
内容
- Bioconductor 2.6入门
- 新软件包
- 其他软件包更改
Bioconductor 2.6入门
安装Biocumon 2.6
- 安装r 2.11。Bioconductor 2.6已明确设计为此版本的R.
- 跟着2021年欧洲杯比分预测 指示。
新软件包
这种生物导体中有37个新包装。
新的序列分析工具地址基础架构（Genomicranges.那RSAMTOOLS.那Girafe.）;芯片SEQ（拜何那CSAR.那图片）;数字基因表达和RNA-SEQ（DESEQ.那Goseq.那Semmentseq.）;和主题发现（图案那RGADEM.）。
微阵列分析包括用于预处理和技术特异性测定的新包装（yefyilm.那frma.那Frmatools.那beaddatapackr.那马萨雷）;特定实验方案分析（魅力那Genocn.那ichip.那甲基）;和新的统计方法（共识那表达式那艾莎那GSRI.那承诺那蒂格雷）。
流式细胞术包装包括Samspectral.那FlowMeans.那FlowTrans.， 和iflow.。
通过与Geo接口的新包装促进了注释和整合分析（地质副本），序列读取存档（SraDB.）和列表的基因组序列项目数据（基因组）;GSRI包以估计基因组中的差异表达基因;PCA和CCA依赖性建模（品脱）;并更新了外显子数组注释的访问权限（xmapcore.）。
详细包装
- yefyilm.- 背景减法和Langmuir等温线的线性模型
- 拜何- 芯片-SEQ数据的贝叶斯分析
- beaddatapackr.- 压缩Illumina Beadarray数据
- 魅力- 来自Charm微阵列的DNA甲基化数据分析
- 共识- 在无监督分析中稳定证据确定集群计数和成员资格的算法
- CSAR.- 分析芯片SEQ数据的统计工具
- DESEQ.- 基于负二氯分布的数字基因expresion分析
- 艾莎- 通过迭代签名算法表达数据分析
- 表达式- 可视化基因表达数据中鉴定的双板
- FlowMeans.- 非参数流式细胞仪数据门控
- FlowTrans.- 流式细胞仪数据变换参数优化
- frma.- 冻结的RMA和条形码
- Frmatools.- 冷冻RMA工具
- Genocn.- 基因分型和副本编号研究工具
- 基因组- 基因组测序项目元数据
- Genomicranges.- 表示和操纵基因组间隔
- 地质副本- 准备微阵列数据以提交给Geo
- Girafe.- 基因组间隔和功能勘探的读取对齐
- Goseq.- 基因本体分析仪用于RNA-SEQ和其他长度偏置数据
- GSRI.- 基因设定规则指数
- 超级拖车- 可视化超基皮
- ichip.- 通过隐藏的ising模型 - 贝叶斯芯片数据建模
- iflow.- 流式细胞术的基于GUI可视化
- Kogcorthology（替换Keggortho）- 图表支持KO，Kegg orthology
- 马萨雷- MassArray数据的分析工具
- 甲基- 用于DNA甲基化数据的可视化和统计方法
- 图案- 主题识别和验证
- 图片- 芯片SEQ的概率推理
- 品脱- 功能基因组学数据的成对集成
- 承诺- 投影到最有趣的统计证据
- RGADEM.- De Novo Motif发现
- RSAMTOOLS.- 将对齐的BAM文件格式序列序列进入R / Biocumond
- Samspectral.- 识别流式细胞术数据中的细胞群
- Semmentseq.- 采用高吞吐量排序数据，并使用它来定义高密度读取对齐的基因组的段
- SraDB.- 从NCBI SRA和工具编辑元数据
- 蒂格雷- 通过高斯过程重建表达式转录因子推断
- xmapcore.- 核心访问XMAP数据库（单独安装）
其他软件包更改
克夫思已被重命名Kogcorthology.。
