GenomicRanges

基因组间隔的表示和操作

Bioconductor版本:2.6

在分析高通量测序数据(又称NGS数据)时，有效存储基因组注释和比对的能力发挥着核心作用。该包定义了用于存储基因组间隔的通用容器，以及用于存储参考基因组比对的更专门的容器。

作者:P. Aboyoun, H. Pages和M. Lawrence

维护者:Biocore Team c/o BioC用户列表

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源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“GenomicRanges”)

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引用(“GenomicRanges”)

文档

PDF		介绍基因组范围
PDF	R脚本	GenomicRanges用例
PDF		参考手册

细节

biocViews	遗传学，测序，HighThroughputSequencing，注释
取决于	R(>= 2.8.0)，方法，IRanges(> = 1.5.74)
进口	方法,IRanges
建议	RUnit，BSgenome，GenomicFeatures，Rsamtools，EatonEtAlChIPseq，leeBamViews，org.Sc.sgd.db，BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2
系统需求
许可证	艺术- 2.0
URL
全靠我	BSgenome，chipseq，GenomicFeatures，图片，Rsamtools，ShortRead，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427
进口我	chipseq，ChIPseqR，GenomicFeatures，leeBamViews，图片，Rsamtools，rtracklayer，ShortRead，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427
建议我
版本	1.0.9
自	Bioconductor 2.6 (R-2.11)

包下载

包的来源	GenomicRanges_1.0.9.tar.gz
Windows二进制	GenomicRanges_1.0.9.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	GenomicRanges_1.0.9.tgz
软件包下载报告	下载数据