生物导体版本:2.6
迭代签名算法(ISA)是一种双簇方法。它发现基因表达(或其他表格)数据中的相关块(转录模块)。ISA能够找到重叠的模块,并且对噪声具有弹性。该软件包使用标准的生物导体数据结构为ISA提供了方便的接口;还包含各种可视化工具,可与其他双簇算法一起使用。
作者:gabor csardi
维护者:gabor csardi
要安装此软件包,请启动R并输入:
来源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ eisa”)
要在出版物中引用此软件包,请启动R并输入:
引用(“ eisa”)
R脚本 | EISA和BICLUST包裹 | |
R脚本 | 用于基因表达数据的迭代签名算法 | |
参考手册 |
生物浏览 | 分类,,,,可视化,,,,微阵列,,,,基因表达 |
要看 | 方法,ISA2,,,,生物酶,,,,AnnotationDbi,,,,类别,,,,GeneFilter,,,,DBI |
进口 | |
建议 | Igraph(> = 0.5.2),矩阵,,,,gostats,,,,go.db,,,,kegg.db,,,,biclust,,,,大量的,,,,Xtable,,,,全部,,,,HGU95AV2.DB |
系统要求 | |
执照 | GPL(> = 2) |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | ExpressionView |
建议我 | |
版本 | 1.0.0 |
自从 | 生物导体2.6(R-2.11) |
包源 | eisa_1.0.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | eisa_1.0.0.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.5(豹)二进制 | eisa_1.0.0.tgz |
软件包下载报告 | 下载统计 |