rsamtools

导入对齐的BAM文件格式序列到R /生物导体中

生物导体版本:2.6

该软件包为操纵SAM(序列对齐 / MAP)格式文件提供了“ Samtools”实用程序的接口。当前可用的设施包括灵活的文件输入。

作者:马丁·摩根(Martin Morgan),herv \'e Pag \`

维护者:Biocore团队C/O Bioc用户列表的BioConductor

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来源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ rsamtools”)

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引用(“ rsamtools”)

文档

PDF R脚本 RSAMTOOLS介绍
PDF 参考手册

细节

生物浏览 DataImport,,,,测序,,,,高通量序列
要看 方法,iranges(> = 1.5.56),基因组机(> = 0.1.0),生物弦(> = 2.15.0)
进口 方法,utils,iranges,,,,基因组机,,,,生物弦
建议 Shortread,,,,GenomicFeatures,,,,kegg.db
系统要求
执照 艺术2.0
URL //www.andersvercelli.com/packages/release/bioc/html/rsamtools.html
取决于我 Ind1kg,,,,Leebamviews,,,,Shortread
进口我 Shortread
建议我 基因组机
版本 1.0.8
自从 生物导体2.6(R-2.11)

软件包下载

包源 rsamtools_1.0.8.tar.gz
Windows二进制 rsamtools_1.0.8.zip(32-和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制 rsamtools_1.0.8.tgz
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