SamSPECTRAL

识别的细胞群在流式细胞仪的数据。

Bioconductor版本:2.6

给定一个矩阵坐标作为输入,SamSPECTRAL首先构建社区样本数据点。然后,它构建一个图和加权后的边缘电导计算,图形传递给一个经典的谱聚类算法找到光谱集群。SamSPECTRAL的最后阶段是结合光谱集群。由此产生的“连接组件”估计生物细胞种群的数据样本。有关手动安装的说明,参考以下文档中提供的PDF文件。

作者:Habil Zare和Parisa Shooshtari

维护人员:Habil Zare < hzare在bccrc.ca >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“SamSPECTRAL”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“SamSPECTRAL”)

文档

PDF	R脚本	修改后的谱聚类方法聚类数据流式细胞术
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学,FlowCytometry,CellBiology,聚类,癌症,FlowCytData,干细胞的,艾滋病毒
取决于	R (> = 2.0.0)
进口	方法
建议
系统需求
许可证	GPL版本2或更新
URL
取决于我
进口我
建议我
版本	1.1.6
自	Bioconductor 2.6 (r - 2.11)

包下载

包的来源	SamSPECTRAL_1.1.6.tar.gz
Windows二进制	SamSPECTRAL_1.1.6.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	SamSPECTRAL_1.1.6.tgz
包下载报告	下载数据