CSAR

用于分析ChIP-seq数据的统计工具

Bioconductor版本:2.6

用于ChIP-seq数据分析的统计工具。该软件包包括Kaufmann等人(2009)PLoS Biology: 7(4):e1000090中描述的统计方法。简单地说，考虑到测序的平均DNA片段大小，该软件计算基因组单核苷酸读-富集值。归一化后，样本和对照使用基于泊松分布的检验进行比较。通过随机排列得到控制误发现率的检验统计阈值。

作者:Jose M Muino

维护者:Jose M Muino < Jose。Muino在wur.nl>

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源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite (CSAR)

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引用(CSAR)

文档

PDF	R脚本	CSAR装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPseq，转录，遗传学
取决于	R (> = 2.6.0)
进口	统计,跑龙套
建议
系统需求
许可证	艺术- 2.0
URL
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版本	1.0.0
自	Bioconductor 2.6 (R-2.11)

包下载

包的来源	CSAR_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	CSAR_1.0.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	CSAR_1.0.0.tgz
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