goseq

用于RNA-seq和其他长度偏倚数据的基因本体分析器

Bioconductor版本:2.6

检测基因本体和/或其他在RNA-seq数据中过度/不足的用户定义类别

作者:马修·杨

维护者:Matthew Young

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“goseq”)

要在出版物中引用此包,请输入R并输入:

引用(“goseq”)

文档

PDF R脚本 goseq用户指南
PDF 参考手册

细节

biocViews HighThroughputSequencingDataGeneExpression转录RNAseq
取决于 R (>= 2.11.0),BiasedUrngeneLenDataBase
进口 mgcv,图形,统计,utils,AnnotationDbi
建议 GO.db刨边机org.Hs.eg.db
系统需求
许可证 LGPL (>= 2)
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版本 1.0.3
Bioconductor 2.6 (R-2.11)

包下载

包的来源 goseq_1.0.3.tar.gz
Windows二进制 goseq_1.0.3.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件 goseq_1.0.3.tgz
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