scrnaseq

doi：10.18129/b9.bioc.scrnaseq

这是发展scrnaseq的版本;对于稳定版本，请参阅scrnaseq。

公共单细胞RNA-seq数据集的收集

生物导体版本：开发（3.16）

基因级计数用于集合的公共SCRNA-seq数据集，该数据集以细胞和基因级元数据为单一的对象提供。

作者：Davide Risso [AUT，CPH]，Michael Cole [AUT]，Aaron Lun [CTB，CRE]，Alan O'Callaghan [CTB]，Jens Preussner [CTB]，Charlotte Soneson [CTB]，Stephany Orjuela [CTB] [CTB]，[CTB]，[CTB]，，，CTB]丹尼尔·布尼斯[CTB]，米兰马尔菲[CTB]

维护者：aaron lun

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ scrnaseq”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ scrnaseq”）

html	R脚本	用户指南
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	实验数据，，，，实验室，，，，表达数据，，，，rnaseqdata，，，，序列数据，，，，Singlecelldata
版本	2.11.0
执照	CC0
要看	Singlecellexperiment
进口	UTIT，方法，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，基因组机，，，，总结性特征，，，，实验室（> = 2.3.4），AnnotationHub（> = 3.3.6），AnnotationDbi，，，，Ensembldb，，，，GenomicFeatures
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Biocfilecache，，，，测试，，，，Rappdirs， 工具
系统要求
增强
URL
取决于我	奥斯卡。
进口我	Singlecelltk
建议我	APL，，，，Batchelor，，，，Bluster，，，，命运，，，，Dittoseq，，，，glimma，，，，我明白，，，，iseehex，，，，iseeu，，，，miqc，，，，mumosa，，，，Scannotatr，，，，评分，，，，scdblfinder，，，，scfeaturefilter，，，，烤饼，，，，斯克兰，，，，Sctreeviz，，，，砍伐，，，，Singlecellexperiment，，，，辛格，，，，总结，，，，Ucell，，，，Velociraptor，，，，Zellkonverter，，，，Zinbwave
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	scrnaseq_2.11.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scrnaseq
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/scrnaseq
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/scrnaseq/
软件包下载报告	下载统计