命运

DOI:10.18129 / B9.bioc.destiny

这是发展命运的版本;稳定版请参见命运．

创建扩散图

Bioconductor版本:开发(3.16)

创建并绘制扩散图。

作者:Philipp Angerer [cre, aut]， Laleh Haghverdi [ctb]， Maren Büttner [ctb]，费比安·泰斯[ctb]， Carsten Marr [ctb]，弗洛里安Büttner [ctb]

维护者:Philipp Angerer

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("destiny")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“命运”)

超文本标记语言	R脚本	命运2.0带来了扩散伪时间(DPT)类
超文本标记语言	R脚本	命运主插图:从这里开始!
超文本标记语言	R脚本	检测与命运相关的基因3
超文本标记语言	R脚本	使用提供的数据重现扩散图小插图()
超文本标记语言	R脚本	全局内核和局部内核的效果
超文本标记语言	R脚本	Tidyverse和ggplot与命运的整合
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文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，CellBiology，聚类，软件，可视化
版本	3.11.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	方法，图形，grDevices，网格，utils，统计，矩阵，Rcpp(> = 0.10.3),RcppEigen，RSpectra(0.14 > = 0),irlba，pcaMethods，Biobase，BiocGenerics，SummarizedExperiment，SingleCellExperiment，ggplot2，ggplot.multistats，tidyr，tidyselect，ggthemes，VIM，knn.covertree，代理，RcppHNSW，平滑，尺度，scatterplot3d
链接	Rcpp，RcppEigen, grDevices
建议	knitr，rmarkdown，igraph，testthat，模糊神经网络，tidyverse，gridExtra，cowplot，矛盾，冬青，rgl，scRNAseq，org.Mm.eg.db，食物，repr
SystemRequirements	c++ 11
增强了	rgl，SingleCellExperiment
URL	https://theislab.github.io/destiny/https://github.com/theislab/destiny/https://www.helmholtz-muenchen.de/icb/destiny//www.andersvercelli.com/packages/destinyhttps://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv715
BugReports	https://github.com/theislab/destiny/issues
全靠我
进口我	CytoTree
建议我	CelliD，CellTrails，单片眼镜
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	destiny_3.11.0.tar.gz
Windows二进制	destiny_3.11.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/destiny
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/destiny
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/destiny/
软件包下载报告	下载数据