APL

doi：10.18129/b9.bioc.apl

这是发展APL的版本；对于稳定版本，请参阅APL。

协会图

生物导体版本：开发（3.16）

APL是用于计算关联图（AP）的软件包，这是一种可视化和分析单细胞转录组学数据的方法。APL的主要重点是从输入数据中鉴定出细胞单个簇的基因特征。该软件包执行对应分析（CA），并允许使用关联图识别群集特异性基因。此外，APL计算所有基因的群集特异性得分，这些基因允许根据其特异性对所选细胞群群进行对基因进行排名。

作者：Elzbieta Gralinska [Cre，Aut]，Clemens Kohl [AUT]，Martin Vingron [aut]

维护者：elzbieta gralinska

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ apl”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

PDF		参考手册

细节

生物浏览	维度，，，，基因表达，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，统计信息
版本	1.1.0
在生物导体中	Bioc 3.15（R-4.2）（<6个月）
执照	GPL（> = 3）
要看	R（> = 4.2）
进口	网状，，，，Ggrepel，，，，GGPLOT2，，，，Viridislite，，，，情节，，，，Seurat，，，，Singlecellexperiment，，，，马格里特，，，，总结性特征，，，，topgo，方法，统计，utils，org.hs.eg.db，org.mm.eg.db，rlang
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，scrnaseq，，，，评分，，，，斯克兰，，，，测试
系统要求	python，pytorch，numpy
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包
Windows二进制	apl_1.1.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/apl
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/apl
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/apl/
软件包下载报告	下载统计