tximeta

doi：10.18129/b9.bioc.tximeta

这是发展tximeta的版本；对于稳定版本，请参阅tximeta。

用自动元数据导入的成绩单定量

生物导体版本：开发（3.16）

转录定量从鲑鱼和Alevin进口，并自动连接转录本范围和释放信息，以及其他相关的元数据。从头转录组可以链接到具有LinkedTxomes的适当来源，并共享用于计算可重复性。

作者：Michael Love [Aut，Cre]，Charlotte Soneson [AUT，CTB]，Peter Hickey [Aut，CTB]，Rob Patro [AUT，CTB]，NIH NHGRI [FND]，CZI [FND]

维护者：迈克尔·洛夫（Michael Love）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ tximeta”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ tximeta”）

html	R脚本	用自动元数据导入的成绩单定量
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，DataImport，，，，功能基因组学，，，，基因表达，，，，基因数，，，，免疫学，，，，预处理，，，，rnaseq，，，，报告写作，，，，reproducibleresearch，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录，，，，转录组学
版本	1.15.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁）
执照	GPL-2
要看
进口	总结性特征，，，，tximport，，，，jsonlite，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，AnnotationDbi，，，，GenomicFeatures，，，，Ensembldb，，，，Biocfilecache，，，，AnnotationHub，，，，生物弦，，，，蒂布尔，，，，GenomeInfodB，工具，utils，方法，矩阵
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，tximportdata，，，，org.dm.eg.db，，，，deseq2，，，，鱼池，，，，EDGER，，，，林玛，，，，DevTools
系统要求
增强
URL	https://github.com/mikelove/tximeta
取决于我	rnaseqgene
进口我	同工型间分析仪
建议我	deseq2，，，，鱼池，，，，氟化物学
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	tximeta_1.15.0.tar.gz
Windows二进制	tximeta_1.15.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	tximeta_1.15.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tximeta
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/tximeta
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/tximeta/
软件包下载报告	下载统计