准

doi：10.18129/b9.bioc.quasr

这是发展Quasr的版本;对于稳定版本，请参阅准。

量化和注释r中的简短读数

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包为简短读取的量化和分析提供了一个框架。它涵盖了一个完整的工作流程，从原始序列读取，对比对的创建和质量控制图，再到目标基因组区域的量化。

作者：Anita Lerch [aut]，夏洛特·索尼森[aut]，Dimos Gaidatzis [AUT]，Michael Stadler [AUT，CRE]

维护者：迈克尔·斯塔德勒（Michael Stadler）<迈克尔·斯塔德勒

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ quasr”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ quasr”）

html	R脚本	Quasr简介
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	结盟，，，，chipseq，，，，覆盖范围，，，，遗传学，，，，免疫学，，，，甲基，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件
版本	1.37.1
在生物导体中	Bioc 2.12（R-3.0）（9年）
执照	GPL-2
要看	R（> = 4.1），并行，基因组机，，，，rbowtie
进口	方法，Grdevices，图形，UTILS，统计，工具，工具，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，生物酶，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，rsamtools（> = 2.13.1），GenomicFeatures，，，，Shortread，，，，生物比较，，，，GenomeInfodB，，，，rtracklayer，，，，Genomicfiles，，，，AnnotationDbi
链接	Rhtslib（> = 1.99.1）
建议	GVIZ，，，，生物使用，，，，基因组签名，，，，RHISAT2，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，COVR，，，，测试
系统要求	gnu做
增强
URL
取决于我
进口我	Singlemoleculefootprinting
建议我	艾萨尔
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	quasr_1.37.1.tar.gz
Windows二进制	Quasr_1.37.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/quasr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/quasr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/quasr/
软件包下载报告	下载统计