- 家
- Biocumon 3.13
- 软件包
- Quasr.
Quasr.
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DOI：10.18129 / b9.bioc.quasr.
量化和注释r的简短读数
Bioconductor版本：释放（3.13）
此包提供了框架，用于量化和分析短读数。它涵盖了从原始序列开始的完整工作流程，在创建对齐和质量控制图中，以定量感兴趣的基因组区域的量化。
作者：Anita Lerch [Aut]，Charlotte Soneson [Aut]
，Dimos Gaidatzis [Aut]，Michael Stadler [Aut，Cre]
维护者：Michael Stadler
引文（从R内，输入引文（“QUASR”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“quasr”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“QUASR”）
| HTML. | r script. | Quasr介绍 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.32.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 2.12（R-3.0）（8年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 依靠 | R（> = 4.0），并行，Genomicranges.那r |
| 进口 | 方法，Grdevices，图形，Util，生物根系那S4Vectors.那绞喉那Biocmanager.那BioBase.那生物仪器那bsgenome.那RSAMTOOLS.那基因组法那缩短那生物相投那genomeinfodb.那rtracklayer.那基因组夫妇那annotationdbi.， 工具 |
| 链接到 | rhtslib. |
| 建议 | GVIZ.那生物焦那基因管理那Rhisat2.那kn那RAMAMAMDOW.那Covr.那testthat. |
| 系统要求 | GNU制作 |
| 加强 | |
| URL. | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | singlemoleculefootprinting. |
| 建议我 | Eisar. |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | quasr_1.32.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | quasr_1.32.0.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | quasr_1.32.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/quasr. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包/ quasr |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/quasr/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
