弗雷泽

doi：10.18129/b9.bioc.fraser

这是发展弗雷泽的版本；对于稳定版本，请参阅弗雷泽。

在RNA-Seq数据中找到罕见的剪接事件

生物导体版本：开发（3.13）

在转录组轮廓中检测罕见异常剪接事件。该工作流程旨在协助执行RNA-Seq的罕见疾病领域的诊断，以识别异常的剪接缺陷。

作者：Christian Mertes [AUT，CRE]，Ines Scheller [AUT]，Vicente Yepez [CTB]，Julien Gagneur [aut]

维护者：Christian Mertes

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: Install（decon ='devel'）biocmanager :: Install（“ fraser”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Fraser”）

PDF	R脚本	弗雷泽（Fraser）：在RNA-seq数据中找到罕见的剪接
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	替代方案，，，，覆盖范围，，，，遗传学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件
版本	1.3.0
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（1年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
依靠	生物比较，，，，Data.Table，，，，rsamtools，，，，总结性特征
进口	AnnotationDbi，，，，bbmisc，，，，生物酶，，，，生物基因，，，，Biomart，，，，BSGENOME，，，，牛仔图，，，，延迟（> = 0.5.11），延迟的matrixstats，，，，渡轮，，，，仿制药，，，，GenomeInfodB，，，，基因组签名，，，，GenomicFeatures，，，，基因组机，，，，iranges，grdevices，GGPLOT2，，，，Ggrepel，，，，HDF5Array，，，，矩阵， 方法，校长，，，，pcamethods，，，，pheatmap，，，，情节，，，，prroc，，，，rcolorbrewer，，，，RHDF5，，，，rsubread，，，，r.utils，，，，S4VECTORS，统计蒂布尔，工具，utils，VGAM
链接	RCPP，，，，rcpparmadillo
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，COVR，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，org.hs.eg.db
系统要求
增强
URL	https://github.com/gagneurlab/fraser
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	fraser_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	fraser_1.3.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	fraser_1.3.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fraser
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/fraser
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/fraser/
软件包下载报告	下载统计