DegReport

doi：10.18129/b9.bioc.degreport

这是发展DegReport的版本；对于稳定版本，请参阅DegReport。

DEG分析报告

生物导体版本：开发（3.14）

创建计数数据差异表达分析的HTML报告。它集成了DESEQ2和Edger Vignettes中提到的一些代码，并根据每个选定基因的折叠变化均值和可变性报告基因的排名列表。

作者：Lorena Pantano [AUT，CRE]，John Hutchinson [CTB]，Victor Barrera [CTB]，Mary Piper [CTB]，Radhika Khetani [CTB]，Kenneth Daily [CTB]，Thanneer Malai Malai Perumal [CTB]，Rory Kirchner [Rory Kirchner [CTB]，Michael Steinbaugh [CTB]

维护者：lorena pantano

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: Install（decon ='devel'）biocmanager :: install（degReport'degReport'degReport'）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ DegReport”）

html	R脚本	QC和下游分析用于差异表达RNA-Seq
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	差异性，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，报告写作，，，，软件，，，，可视化
版本	1.29.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（6。5年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 3.6.0）
进口	UTIT，方法，生物酶，，，，生物基因，，，，扫帚，，，，循环，，，，复杂的图像，，，，牛仔图，，，，共识ClusterPlus，，，，簇，，，，deseq2，，，，dplyr，，，，EDGER，，，，GGPLOT2，，，，ggdendro， 网格，Ggrepel，grdevices，尼特，，，，记录，，，，拉索2，，，，马格里特，，，，喷嘴.r1，，，，心理，，，，rcolorbrewer，，，，重塑，，，，rlang，，，，秤，统计Stringr，，，，S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，花花公子，，，，蒂布尔
链接
建议	生物使用，，，，AnnotationDbi，，，，林玛，，，，pheatmap，，，，rmarkDown，，，，Statmod，，，，测试
系统要求
增强
URL	http://lpantano.github.io/degreport/
BugReports	https://github.com/lpantano/degreport/issues
取决于我
进口我	Isomirs
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	degReport_1.29.0.tar.gz
Windows二进制	degReport_1.29.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	degReport_1.29.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/degreport
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/degReport
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/degreport/
软件包下载报告	下载统计