Isomirs

doi:10.18129/b9.bioc.isomirs

这是发展Isomirs的版本;对于稳定版本,请参阅Isomirs

分析来自小RNA-Seq的异构体和miRNA

生物导体版本:开发(3.16)

miRNA和异构体的表征,聚类和差异表达。

作者:Lorena Pantano [AUT,CRE],佐治亚州escaramis [aut](ciberesp -ciberesp -ciber epidemiologia y salud publica)

维护者:lorena pantano

引用(从r内,输入引用(“ Isomirs”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ isomirs”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Isomirs”)

html R脚本 miRNA和Isomir分析
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 聚类,,,,差异性,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,软件,,,,mirna
版本 1.25.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(6年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 r(> = 3.5),歧视者,,,,总结性特征
进口 AnnotationDbi,,,,断言,,,,生物基因,,,,生物酶,,,,扫帚,,,,,,,,牛仔图,,,,DegReport,,,,deseq2,,,,iranges,,,,dplyr,,,,基因组机,,,,GPLOTS,,,,GGPLOT2,,,,gtools,,,,栅格,网格,grdevices,图形,ggally,,,,林玛, 方法,rcolorbrewer,,,,readr,,,,重塑,,,,rlang,统计Stringr,,,,S4VECTORS,,,,花花公子,,,,蒂布尔
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,org.mm.eg.db,,,,targetscan.hs.eg.db,,,,pheatmap,,,,生物使用,,,,测试
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/lpantano/isomirs/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 isomirs_1.25.0.tar.gz
Windows二进制 isomirs_1.25.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) isomirs_1.25.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isomirs
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/isomirs
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/isomirs/
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