targetscan.hs.eg.db

doi:10.18129/b9.bioc.targetscan.hs.eg.db

这是发展targetscan.hs.eg.db的版本;对于稳定版本,请参阅targetscan.hs.eg.db

人类的靶标miRNA目标预测

生物导体版本:开发(3.16)

targetscan miRNA的目标预测人类组装使用来自TargetScan网站的数据。通过寻找与每个miRNA的种子区域相匹配的保守的8mer和7mer位点的存在,可以预测miRNA的生物靶标。还确定的是种子区域中不匹配的位点,这些位点是通过保守3'配对来补偿的。在哺乳动物中,根据使用位点的上下文得分计算的靶向效力对预测进行排名。

作者:gabor csardi

维护者:James F. Reid

引用(从r内,输入引用(“ targetscan.hs.eg.db”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(sentram install(version ='devel')biocmanager :: install(“ targetscan.hs).eg.db“)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

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文本 执照

细节

生物浏览 AnnotationData,,,,函数通道
版本 0.6.1
执照 文件执照
要看 R(> = 2.7.0),方法,AnnotationDbi(> = 1.18.3)
进口 方法,AnnotationDbi
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包装档案

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源包 targetScan.hs.eg.db_0.6.1.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/targetscan.hs.eg.db/
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