这是发展EpitXDB的版本;对于稳定版本,请参阅epitxdb。
生物导体版本:开发(3.16)
epitXDB促进了表面翻译信息的存储。更具体地说,它可以跟踪修改身份,位置,将其引入RNA的酶,该酶是确定要修改的RNA上位置的指定符,并且文献参考每个修改都与之相关联。
维护者:Felix G.M.ernst
引用(从r内,输入引用(“ epitxdb”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ epitxdb”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ epitxdb”)
html | R脚本 | epitxdb |
html | R脚本 | epitxdb-reation |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 表面参考组学,,,,软件 |
版本 | 1.9.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(2年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 4.0),AnnotationDbi,,,,modstrings |
进口 | 方法,utils,httr,,,,XML2,,,,卷曲,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,GenomeInfodB,,,,生物基因,,,,Biocfilecache,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,rsqlite,,,,DBI,,,,生物弦,,,,Trnadbimport |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,httptest,,,,AnnotationHub,,,,Ensembldb,,,,GGPLOT2,,,,epitxdb.hs.hg38,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38,,,,BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER3,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/felixernst/epitxdb |
BugReports | https://github.com/felixernst/epitxdb/issues |
取决于我 | epitxdb.hs.hg38,,,,epitxdb.mm.mm10,,,,epitxdb.sc.saccer3 |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | epitxdb_1.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | epitxdb_1.9.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | epitxdb_1.9.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epitxdb |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/epitxdb |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/epitxdb/ |
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