epitxdb

doi:10.18129/b9.bioc.epitxdb

这是发展EpitXDB的版本;对于稳定版本,请参阅epitxdb

使用AnnotationDBI接口存储和访问关注分类图信息

生物导体版本:开发(3.16)

epitXDB促进了表面翻译信息的存储。更具体地说,它可以跟踪修改身份,位置,将其引入RNA的酶,该酶是确定要修改的RNA上位置的指定符,并且文献参考每个修改都与之相关联。

作者:Felix G.M.恩斯特[aut,cre]

维护者:Felix G.M.ernst

引用(从r内,输入引用(“ epitxdb”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ epitxdb”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ epitxdb”)

html R脚本 epitxdb
html R脚本 epitxdb-reation
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 表面参考组学,,,,软件
版本 1.9.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(2年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 4.0),AnnotationDbi,,,,modstrings
进口 方法,utils,httr,,,,XML2,,,,卷曲,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,GenomeInfodB,,,,生物基因,,,,Biocfilecache,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,rsqlite,,,,DBI,,,,生物弦,,,,Trnadbimport
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,httptest,,,,AnnotationHub,,,,Ensembldb,,,,GGPLOT2,,,,epitxdb.hs.hg38,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38,,,,BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER3,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown
系统要求
增强
URL https://github.com/felixernst/epitxdb
BugReports https://github.com/felixernst/epitxdb/issues
取决于我 epitxdb.hs.hg38,,,,epitxdb.mm.mm10,,,,epitxdb.sc.saccer3
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 epitxdb_1.9.0.tar.gz
Windows二进制 epitxdb_1.9.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) epitxdb_1.9.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epitxdb
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/epitxdb
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/epitxdb/
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