Bioconcotk.

DOI：10.18129 / b9.bioc.bioconcotk.

这是发展Bioconcotk的版本;对于稳定的版本版本，请参阅Bioconcotk.。

一般癌症基因组学的生物导体组分

Bioconducts版本：开发（3.14）

提供各种工具的中央界面，用于癌症研究的基因组规范分析。

作者：Vince Carey

维护者：vj carey

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）＃以下初始化Buoc Devel Biocmanager :: Install（版本='devel'）BiocManager ::安装（“BioConcotk”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Bioconcotk”）

HTML.	r script.	Bioconcotk - 生物导体的癌症取向组分
HTML.	r script.	CutatedMsidata概述
HTML.	r script.	将TCGA肿瘤码映射到NCIT
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	复印机那CPGISLAND那德甲基化那基因表达那遗传性那免疫学那SNP.那软件那转录
版本	1.13.0
在生物导体中以来	BIOC 3.7（R-3.5）（3年）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.6.0），方法，utils
进口	ComplexHeatMap.那S4Vectors.那bigrquery.那闪亮的，统计，httr.那rjson.那dplyr.那Magrittr.， 网格，DT.那Genomicranges.那绞喉那ggplot2.那概括分析那DBI.那基因组法，cutatedtcgadata，秤那ggpubr.那普利尔那车那图形那rghrachviz
链接到
建议	kn那dbplyr.，org.hs.eg.db，MultiAsaySayexperiment.那生物焦那ontoproc.那ontologyplot.那波音那Genomeinfodb.那休息（> = 1.3.7），biocfilecache.，txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene，BioBase.，txdb.hsapiens.ucsc.hg18.knowngene，重塑2.那testthat.那annotationdbi.，fdb.infiniummethylation.hg19，ensdb.hsapiens.v75，RAMAMAMDOW.那RHDF5CLIEL.
系统要求
加强
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取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	bioconcotk_1.13.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）	bioconcotk_1.13.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocondudard.org/packages/bioconcotk.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/生物电键
包短网址	https://biocondion.org/packages/bioconcotk/
包裹下载报告	下载统计信息