生物导体版本:版本(3.13)
在EMBL-EBI GWAS目录中代表和建模数据。
作者:vj Carey
维护者:vj Carey
引用(从r内,输入引用(“ Gwascat”)):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gwascat”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Gwascat”)
| html | R脚本 | GWASCAT- GRANGE for GWAS HITS中的EBI目录 |
| html | R脚本 | Gwascat:结构和查询NHGRI GWAS目录 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
| 生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
| 版本 | 2.24.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.10(R-2.15)(9年) |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R(> = 3.5.0),方法 |
| 进口 | S4VECTORS(> = 0.9.25),iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机(> = 1.29.6),GenomicFeatures,,,,readr,,,,生物弦,,,,AnnotationDbi,,,,Biocfilecache,,,,snpstats,,,,变体,,,,AnnotationHub |
| 链接 | |
| 建议 | do.db,,,,DT,,,,尼特,,,,rbgl,,,,测试,,,,rmarkDown,,,,GVIZ,,,,rsamtools,,,,iranges,,,,rtracklayer,,,,图形,,,,GGBIO,,,,延迟,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,org.hs.eg.db,,,,生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37 |
| URL | |
| 取决于我 | 举起,,,,vtpnet |
| 进口我 | Circrnaprofiler |
| 建议我 | GenomicsCores,,,,grasp2db,,,,hmdbquery,,,,ldblock,,,,parglms,,,,tfutils |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | gwascat_2.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | gwascat_2.24.0.zip(32-和64位) |
| MacOS 10.13(高山脉) | gwascat_2.24.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwascat |
| 源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/gwascat |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/gwascat/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
文档»
生物导体