snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.

DOI:10.18129 / b9.bioc.snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.

Homo Sapiens的SNP位置(DBSNP Build 144)

Bioconductor版本:释放(3.13)

从NCBI DBSNP构建中提取的SNP位置和同性恋者的等位基因144.在2015年5月29日至30日,NCBI创建了用于此包的源数据文件,并包含映射到参考基因组GCH37.P13的SNP。警告:请注意,GRCH37.P13 Genome是GRCH37的修补版本。然而,贴片不会改变染色体1-22,x,y,mt。GRCH37本身与来自UCSC *的HG19基因组相同,除了线粒体染色体之外。因此,该包装中的SNP可以在bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19中“注入”,它们将在正确的位置降落,但该喷射将排除CHRM(即,没有任何内容注入该序列)。

作者:HervéPagès

维护者:H.Pagès

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版本 0.99.20
执照 艺术-2.0
依靠 bsgenome.(> = 1.43.4)
进口 方法,Utils,生物根系S4Vectors.绞喉Genomeinfodb.Genomicranges.bsgenome.
链接到
建议 生物仪器bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
加强
URL.
取决于我 EQTL.
进口我
建议我 等位基因矛纪基因组织mafdb.1kgenomes.phase1.hs37d5.mafdb.1kgenomes.phase3.hs37d5.mafdb.exac.r1.0.hs37d5.mafdb.exac.r1.0.nontcga.hs37d5.mafdb.gnomad.r2.1.hs37d5.mafdb.gnomadex.r2.1.hs37d5.mafdb.topmed.freeze5.hg19.mungesumstats.变型滤波器xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.
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源包 snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37_0.99.20.tar.gz.
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