升降机

DOI：10.18129 / b9.bioc.liftover

使用rtracklayer ::升降装置改变基因组坐标系

Biocometiond版本：释放（3.12）

与UCSC浏览器跟踪基础设施一起开发的提升设备可用于转换GANGES格式的数据。这与EBI / NHGRI GWAS目录的图像一起示出，即，截至2017年5月10日，该图像与由NCBI构建HG38定义的坐标分发。

作者：Bioconductor包维护者[AUT，CRE]

维护者：Bioconductor Package维护者

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“升降机”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“升降机”）

HTML.

r script.

使用rtracklayer ::升降装置改变基因组坐标系

细节

Biocviews.	基础工作那工作流程
版本	1.14.0.
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.3.0），Gwascat那Genomicranges.那rtracklayer.那homo.sapiens.那生物根系
进口
链接到
建议	kn那RAMAMAMDOW.那生物焦
系统要求
加强
URL.	https://www.biocumon.org/help/workflows/liftover/
取决于我
进口我
建议我
链接给我

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	升降_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/liftover
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/升降机
包短网址	https://biocumon.org/packages/liftor/
包裹下载报告	下载统计信息