celldex

DOI:10.18129 / B9.bioc.celldex

这是发展celldex版本;稳定的发布版本,请参阅celldex。

细胞类型的参考指数

Bioconductor版本:发展(3.16)

为引用的集合表达数据集提供策划细胞类型标签,用于过程自动化注释的单细胞数据或散装RNA-seq反褶积。

作者:Dvir亚兰(aut),亚伦Lun (cre, aut cph],丹尼尔Bunis (aut),贾里德·安德鲁斯(aut) Friederike Dundar (aut)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“celldex”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“celldex”)

HTML	R脚本	细胞类型的引用
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,RNASeqData,SequencingData
版本	1.7.0
许可证	GPL-3
取决于	SummarizedExperiment
进口	跑龙套,ExperimentHub,AnnotationHub,AnnotationDbi,S4Vectors,DelayedArray,DelayedMatrixStats
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,DT
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/LTLA/celldex
BugReports	https://support.bioconductor.org/
取决于我	OSCA。工作流,SingleRBook
进口我	singleCellTK
建议我	ontoProc,单,tidySingleCellExperiment
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	celldex_1.7.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/celldex
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ celldex
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/celldex/
包下载报告	下载数据