这是发展TENxPBMCData的版本;稳定发布版本请参见TENxPBMCData.
Bioconductor版本:开发(3.16)
PBMC细胞的单细胞RNA-seq数据,由10X Genomics生成。
作者:Kasper D. Hansen [aut], Davide Risso [aut], Milan Malfait [ctb], Jeroen Gilis [ctb], Theodore Killian [ctb], Murat Cem Kose [ctb], Chong Tang [ctb], Teun van den Brand [ctb], Dania Machlab [ctb], Stephanie Hicks [aut, ctb]
维护人员:Stephanie Hicks
引用(从R中,输入引用(“TENxPBMCData”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("TENxPBMCData")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“TENxPBMCData”)
超文本标记语言 | R脚本 | 从10X Genomics获取PBMCs上的scRNA-seq数据 |
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,RNASeqData,SequencingData,SingleCellData |
版本 | 1.15.0 |
许可证 | Cc / 4.0 |
取决于 | SingleCellExperiment,HDF5Array |
进口 | AnnotationHub,ExperimentHub |
链接 | |
建议 | rmarkdown,knitr,BiocStyle,雪,BiocFileCache,BiocParallel |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | OSCA。multisample, SingleRBook |
进口我 | singleCellTK |
建议我 | ASURAT,celda,ExperimentSubset,fcoex,glmGamPoi,iSEE,mbkmeans,schex,司康饼,用水晶球占卜,transformGamPoi |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | TENxPBMCData_1.15.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/TENxPBMCData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TENxPBMCData |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/TENxPBMCData/ |
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