TENxPBMCData

DOI:10.18129 / B9.bioc.TENxPBMCData

这是发展TENxPBMCData的版本;稳定发布版本请参见TENxPBMCData

来自10X Genomics的PBMC数据

Bioconductor版本:开发(3.16)

PBMC细胞的单细胞RNA-seq数据,由10X Genomics生成。

作者:Kasper D. Hansen [aut], Davide Risso [aut], Milan Malfait [ctb], Jeroen Gilis [ctb], Theodore Killian [ctb], Murat Cem Kose [ctb], Chong Tang [ctb], Teun van den Brand [ctb], Dania Machlab [ctb], Stephanie Hicks [aut, ctb]

维护人员:Stephanie Hicks

引用(从R中,输入引用(“TENxPBMCData”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("TENxPBMCData")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“TENxPBMCData”)

超文本标记语言 R脚本 从10X Genomics获取PBMCs上的scRNA-seq数据
PDF 参考手册

细节

biocViews ExperimentDataExperimentHubExpressionDataRNASeqDataSequencingDataSingleCellData
版本 1.15.0
许可证 Cc / 4.0
取决于 SingleCellExperimentHDF5Array
进口 AnnotationHubExperimentHub
链接
建议 rmarkdownknitrBiocStyleBiocFileCacheBiocParallel
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 OSCA。multisample, SingleRBook
进口我 singleCellTK
建议我 ASURATceldaExperimentSubsetfcoexglmGamPoiiSEEmbkmeansschex司康饼用水晶球占卜transformGamPoi
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 TENxPBMCData_1.15.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/TENxPBMCData
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TENxPBMCData
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/TENxPBMCData/
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