transformGamPoi

DOI:10.18129 / B9.bioc.transformGamPoi

这是发展transformGamPoi版本;稳定发布版本请参见transformGamPoi．

γ -泊松模型的方差稳定变换

Bioconductor版本:开发(3.16)

方差稳定转换有助于异方差数据(即，方差不是常数的数据，如计数数据)的分析。这个包提供了两种类型的方差稳定转换:(1)基于增量方法的方法(例如，'acosh'， 'log(x+1)')，(2)基于模型残差的方法(皮尔逊和随机分位数残差)。

作者:Constantin Ahlmann-Eltze

维护人员:Constantin Ahlmann-Eltze

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("transformGamPoi")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“transformGamPoi”)

超文本标记语言	R脚本	glmGamPoi快速入门
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	归一化，预处理，回归，SingleCell，软件
版本	1.3.1
Bioconductor自	BioC 3.14 (R-4.1)(1年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	glmGamPoi，DelayedArray，矩阵，MatrixGenerics，SummarizedExperiment，HDF5Array、方法、跑龙套Rcpp
链接	Rcpp
建议	testthat，TENxPBMCData，食物，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/const-ae/transformGamPoi
BugReports	https://github.com/const-ae/transformGamPoi/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	transformGamPoi_1.3.1.tar.gz
Windows二进制	transformGamPoi_1.3.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	transformGamPoi_1.3.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transformGamPoi
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ transformGamPoi
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/transformGamPoi/
包下载报告	下载数据