RibosomeProfilingQC

doi：10.18129/b9.bioc.ribosomeprofilingqc

这是发展RibosomeProfilingQC的版本;对于稳定版本，请参阅RibosomeProfilingQC。

核糖体分析质量控制

生物导体版本：开发（3.13）

Ribo-Seq（也称为核糖体分析或足迹）通过直接量化核糖体保护的片段（RPFS）进行翻译（与RNA-Seq不同，与RNA-Seq相比）。该软件包为核糖体分析的质量评估提供了工具。此外，它可以预处理核糖序列数据以进行后续差分分析。

作者：Jianhong OU [AUT，CRE]，Mariah Hoye [aut]

维护者：jianhong ou

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: Install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ ribosomeproforigilingqc”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ ribosomeprofilingqc”）

html	R脚本	RibosomeProfilingQC Vignette
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	覆盖范围，，，，结肠管制，，，，QualityControl，，，，核糖，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.3.0
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（0.5岁）
执照	GPL（> = 3） +文件执照
要看	r（> = 4.0），基因组机
进口	AnnotationDbi，，，，生物基因，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，EDASEQ，，，，基因组签名，，，，GenomicFeatures，，，，GenomeInfodB，，，，iranges， 方法，Motifstack，，，，rtracklayer，，，，rsamtools，，，，Ruvseq，，，，rsubread，，，，S4VECTORS，，，，xvector，，，，GGPLOT2，，，，ggfittext，，，，秤，，，，Ggrepel，utils，簇，统计，图形，网格
链接
建议	运行，，，，生物使用，，，，尼特，，，，BSGENOME.DRERIO.UCSC.DANRER10，，，，EDGER，，，，林玛，，，，测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ribosomeProfilingqc_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	ribosomeProfilingqc_1.3.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	ribosomeProfilingqc_1.3.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ribosomeprofilingqc
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/ribosomeprofilingqc
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/ribosomeprofilingqc/
软件包下载报告	下载统计