Compepitools

doi：10.18129/b9.bioc.compepitools

这是发展compepitools的版本；对于稳定版本，请参阅Compepitools。

计算表观基因组学的工具

生物导体版本：开发（3.16）

开发了用于分析，集成和同时可视化多个样本中多个基因组区域的各种（EPI）基因组学数据类型的计算表观基因组学工具。

作者：Mattia Pelizzola [AUT]，Kamal Kishore [AUT，CRE]

维护者：kamal kishore

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ compepitools”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ compepitools”）

PDF	R脚本	compepitools.pdf
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	覆盖范围，，，，基因表达，，，，基因数，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.31.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（7。5年）
执照	GPL
要看	r（> = 3.5.0），方法，topgo，，，，基因组机
进口	AnnotationDbi，，，，生物基因，，，，生物弦，，，，rsamtools，并行，grdevices，GPLOTS，，，，iranges，，，，GenomicFeatures，，，，xvector，，，，甲基管，，，，go.db，，，，S4VECTORS，，，，GenomeInfodB
链接
建议	bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm9，，，，org.mm.eg.db，，，，尼特，，，，rtracklayer
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	compepitools_1.31.0.tar.gz
Windows二进制	compepitools_1.31.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	compepitools_1.31.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compepitools
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/compepitools
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/compepitools/
软件包下载报告	下载统计