Egsea

doi：10.18129/b9.bioc.egsea

这是发展Egsea的版本；对于稳定版本，请参阅Egsea。

基因集富集分析的合奏

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包实现了用于基因集测试的基因集富集分析（EGSEA）方法。

作者：Montrer Alhamdoosh，Luyi Tian，Milica Ng和Matthew Ritchie

维护者：Monterer Alhamdoosh

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ egsea”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Egsea”）

PDF	R脚本	Egsea小插图
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	分类，，，，差异性，，，，去，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，基因信号，，，，遗传学，，，，遗传学，，，，GraphandNetwork，，，，免疫学，，，，kegg，，，，代谢组学，，，，微阵列，，，，多重组合，，，，网络，，，，NetworkEnrichment，，，，Onechannel，，，，途径，，，，蛋白质组学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，系统生物学，，，，两通道
版本	1.25.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（6年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.5），生物酶，，，，量规（> = 2.14.4），AnnotationDbi，，，，topgo（> = 2.16.0），PathView（> = 1.4.2）
进口	padog（> = 1.6.0），GSVA（> = 1.12.0），全球测试（> = 5.18.0），林玛（> = 3.20.9），EDGER（> = 3.6.8），htmlutils（> = 0.1.5），HWRITER（> = 1.2.2），GPLOTS（> = 2.14.2），GGPLOT2（> = 1.0.0），安全的（> = 3.4.0），Stringi（> = 0.5.0），并行，统计，代码，grdevices，图形，utils，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，org.rn.eg.db，，，，rcolorbrewer， 方法，Egseadata（> = 1.3.1），htmlwidgets，，，，情节，，，，DT
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，测试
系统要求
增强
URL
取决于我	EGSEA123
进口我
建议我	Egseadata，，，，tidybulk
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	egsea_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	egsea_1.25.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	egsea_1.25.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/egsea
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/egsea
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/egsea/
软件包下载报告	下载统计