海市蜃楼

DOI:10.18129 / B9.bioc.MiRaGE

这是发展版本的海市蜃楼;稳定的发布版本,请参阅海市蜃楼。

microrna的排名由基因表达

Bioconductor版本:发展(3.16)

包包含函数inferece microrna基因调控的目标,基于目标基因表达谱。

作者:Y-h。田口方法在granular.com <标记>

维护人员:Y-h。田口方法在granular.com <标记>

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“海市蜃楼”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“海市蜃楼”)

PDF	R脚本	如何使用幻影包
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,RNASeq,圣人,测序,软件
版本	1.39.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(9.5年)
许可证	GPL
取决于	R (> = 3.1.0),Biobase(> = 2.23.3)
进口	BiocGenerics,S4Vectors,AnnotationDbi,BiocManager
链接
建议	seqinr(> = 3.0.7),biomaRt(> = 2.19.1),GenomicFeatures(> = 1.15.4),Biostrings(> = 2.31.3),BSgenome.Hsapiens.UCSC。hg19 BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10,miRNATarget,humanStemCell,IRanges,GenomicRanges(> = 1.8.3),BSgenome,beadarrayExampleData
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	MiRaGE_1.39.0.tar.gz
Windows二进制	MiRaGE_1.39.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	MiRaGE_1.39.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MiRaGE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/海市蜃楼
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MiRaGE/
包下载报告	下载数据