DESCAN2

doi：10.18129/b9.bioc.descan2

这是发展DESCAN2的版本；对于稳定版本，请参阅DESCAN2。

差分富集扫描2

生物导体版本：开发（3.16）

集成峰和差分呼叫者，专为广泛的表观基因组信号而设计。

作者：Dario Righelli [AUT，CRE]，John Koberstein [AUT]，Bruce Gomes [aut]，Nancy Zhang [aut]，Claudia Angelini [aut]，Lucia Peixoto [aut]，Davide Risso [aut]

维护者：dario righelli

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（desiral ='devel'）biocmanager :: install（“ descan2”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Descan2”）

html	R脚本	DESCAN2小插图
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	覆盖范围，，，，表观遗传学，，，，免疫学，，，，峰值探测，，，，测序，，，，软件
版本	1.17.0
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（4年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.5），基因组机
进口	生物比较，，，，生物基因，，，，Chippeakanno，，，，Data.Table，，，，延迟，，，，GenomeInfodB，，，，基因组签名，，，，胶水，，，，iranges，，，，plyr，，，，RCPP（> = 0.12.13），rtracklayer，，，，S4VECTORS（> = 0.23.19），总结性特征，工具，UTILS
链接	RCPP，，，，rcpparmadillo
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，EDGER，，，，林玛，，，，EDASEQ，，，，Ruvseq，，，，rcolorbrewer，，，，Statmod
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	DESCAN2_1.17.0.TAR.GZ
Windows二进制	DESCAN2_1.17.0.ZIP
MacOS 10.13（高山脉）	DESCAN2_1.17.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/descan2
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/descan2
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/descan2/
软件包下载报告	下载统计