等位基因平衡

doi:10.18129/b9

这是发展等位基因平衡的版本;对于稳定版本,请参阅等位基因平衡

研究等位基因特定表达

生物导体版本:开发(3.16)

使用RNA-seq数据为等位基因表达研究提供了一个框架。

作者:Jesper R Gadin,Lasse Folkersen

维护者:jesper r gadin

引用(从r内,输入引用(“等位基因平衡”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ allelelicimmbalance”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“等位基因平衡”)

PDF R脚本 等位基因平衡小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 遗传学,,,,基础设施,,,,测序,,,,软件
版本 1.35.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(8。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 4.0.0),网格,基因组机(> = 1.31.8),总结性特征(> = 0.2.0),基因组签名(> = 1.15.6)
进口 方法,生物基因,,,,AnnotationDbi,,,,BSGENOME(> = 1.47.3),变体(> = 1.25.11),生物弦(> = 2.47.6),S4VECTORS(> = 0.17.25),iranges(> = 2.13.12),rsamtools(> = 1.99.3),GenomicFeatures(> = 1.31.3),GVIZ,,,,格子,,,,LatticeExtra,,,,栅格,,,,seqinr,,,,GenomeInfodB,,,,nlme
链接
建议 测试,,,,org.hs.eg.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/pappewaio/allelicimbalance
BugReports https://github.com/pappewaio/allelicimbalance/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Allelicimbalance_1.35.0.tar.gz
Windows二进制 AlleLicimbalance_1.35.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Allelicimbalance_1.35.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/allowricimbalance
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/等位基因影响
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/allowricimbalance/
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