生物导体版本:版本(3.15)
Seqlogo采用DNA序列基序的位置权重矩阵,并绘制Schneider和Stephens(1990)引入的相应序列徽标。
作者:Oliver Bembom [Aut],Robert Ivanek [Aut,Cre]
维护者:Robert Ivanek
引用(从r内,输入引用(“ seqlogo”)):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ seqlogo”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ seqlogo”)
| html | R脚本 | DNA序列比对的序列徽标 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
| 生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.62.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.0(R-2.5)(15年) |
| 执照 | LGPL(> = 2) |
| 要看 | R(> = 4.2),方法,网格 |
| 进口 | Stats4,Grdevices |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/ivanek/seqlogo/issues |
| 取决于我 | 结肠管制,,,,rgadem |
| 进口我 | IGVR,,,,兴趣,,,,pwmenrich,,,,rgadem,,,,riboseqr,,,,碎片,,,,TFBSTOOLS |
| 建议我 | Bcrank,,,,difflogo,,,,玛格尔,,,,主题,,,,主题,,,,Universalmotif |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | seqlogo_1.62.0.tar.gz |
| Windows二进制 | seqlogo_1.62.0.zip |
| MacOS 10.13(高山脉) | seqlogo_1.62.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqlogo |
| 源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqlogo |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/seqlogo/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
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