seqgsea

doi：10.18129/b9.bioc.seqgsea

RNA-seq数据的基因集富集分析（GSEA）：整合差异表达和剪接

生物导体版本：版本（3.13）

该软件包通常通过整合差异表达和剪接来提供基因集富集分析的基因集富集分析。它使用负二项式分布来模拟读取计数数据，这说明了测序偏见和生物学变异。基于置换测试，也可以分别针对每个基因的差异表达和剪接来实现统计学意义。

作者：xi wang

维护者：xi wang

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ seqgsea”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ seqgsea”）

PDF	R脚本	使用SEQGSEA软件包对RNA-SEQ数据的基因集富集分析
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.32.0
在生物导体中	Bioc 2.12（R-3.0）（8年）
执照	GPL（> = 3）
要看	生物酶，，，，多帕尔，，，，deseq2
进口	方法，Biomart
链接
建议	基因组机
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	seqgsea_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	seqgsea_1.32.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	seqgsea_1.32.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqgsea
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/seqgsea
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/seqgsea/
软件包下载报告	下载统计