注解

doi:10.18129/b9.bioc.notation

这是发展注释的版本;对于稳定版本,请参阅注解

基因组注释资源

生物导体版本:开发(3.16)

注释资源占生物导体项目的很大比例。还有一套可用的在线资源,可以使用特定的软件包访问。本演练将描述这些资源中最受欢迎的资源,并提供一些有关如何使用它们的高级示例。

作者:Marc RJ Carlson [aut],Herve Pages [AUT],Sonali Arora [aut],Valerie Obenchain [aut],Martin Morgan [AUT],Bioconductor Package Wearter [CRE]

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“注释”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“注释”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“注释”)

html R脚本 注释基因组范围
html R脚本 基因组注释资源

细节

生物浏览 注释工作流,,,,工作流程
版本 1.21.1
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.3.0),变体,,,,AnnotationHub,,,,有机体,txdb.hsapiens.ucsc.hg19.nowngene,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nowngene,txdb.mmusculus.ucsc.mmssc.mm10.ensgene,org.hs.hs.hs.eg.g.db,org.mm.g.mm.eg.db,homo.sapiensenseens.db,homo.sapiensenseens,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,Biomart,,,,BSGENOME,txdb.Athaliana.biomart.plantsmart22
进口
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL //www.andersvercelli.com/help/workflows/annotation/annotation_resources/
取决于我
进口我
建议我
链接到我

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Annotation_1.21.1.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annotation
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/注释
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/annotation/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户