curatedAdipoChIP

DOI:10.18129 / B9.bioc.curatedAdipoChIP

这是发展curatedAdipoChIP版本;稳定的发布版本,请参阅curatedAdipoChIP。

一个策划ChIP-Seq MDI-induced分化脂肪细胞(3 t3-l1)的数据集

Bioconductor版本:发展(3.16)

公开的数据集策划ChIP-sequencing转录因子,染色质remodelers和组蛋白修饰在3 t3-l1 pre-adipocyte细胞系。包的文档数据收集、预处理和处理数据。除了文档,包包含用于生成数据的脚本。

作者:马哈茂德•艾哈迈德(aut (cre)

维修工:马哈茂德•艾哈迈德< mahmoud.s。法米在students.kasralainy.edu.eg >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“curatedAdipoChIP”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“curatedAdipoChIP”)

HTML	R脚本	使用curatedAdipoChIP
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeqData,ExperimentData,ExperimentHub,地理,SequencingData
版本	1.13.0
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6),SummarizedExperiment,ExperimentHub
进口
链接
建议	knitr,rmarkdown,GenomicFeatures,ChIPseeker,AnnotationDbi,S4Vectors,DESeq2,fastqcr,devtools,testthat,readr,dplyr,tidyr,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/MahShaaban/curatedAdipoChIP
BugReports	https://github.com/MahShaaban/curatedAdipoChIP/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	curatedAdipoChIP_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/curatedAdipoChIP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ curatedAdipoChIP
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/curatedAdipoChIP/
包下载报告	下载数据