targetscan.Hs.eg.db

DOI:10.18129 / B9.bioc.targetscan.Hs.eg.db

TargetScan miRNA靶向人类预测

Bioconductor版本:发布(3.12)

TargetScan miRNA靶标预测人类使用TargetScan网站收集的数据。TargetScan通过寻找与每个miRNA种子区相匹配的保守的8mer和7mer位点来预测miRNA的生物学靶点。同时也发现了在种子区域有不匹配的位点，通过保守的3'配对来补偿。在哺乳动物中，预测的排名是基于使用网站的上下文分数计算的目标效果的预测。

作者:Gabor Csardi

维护人员:詹姆斯·f·里德<詹姆斯。里德在ifom-ieo-campus.it >

安装

要安装这个包，启动R(版本为“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("targetscan. hsg .db")

对于旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	AnnotationData,FunctionalAnnotation
版本	0.6.1
许可证	文件许可证
取决于	R(>= 2.7.0)，方法，AnnotationDbi(> = 1.18.3)
进口	方法,AnnotationDbi
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	BioCor,eisa,isomiRs
我的链接

包档案

遵循安装在你的R会话中使用这个包的说明。

源包	targetscan.Hs.eg.db_0.6.1.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/targetscan.Hs.eg.db/
包下载报告	下载数据