Weitrix

doi：10.18129/b9.bioc.weitrix

这是发展Weitrix的版本；对于稳定版本，请参阅Weitrix。

具有精确权重，测试和探索加权或稀疏数据的矩阵工具

生物导体版本：开发（3.16）

数据类型和工具，用于使用具有精确权重和缺少数据的矩阵。该软件包提供了一种常见的表示和工具，可以与许多类型的高通量数据一起使用。权重的含义与基本r函数“ LM”和软件包“ Limma”中的使用兼容。校准权重考虑已知的精度预测指标。找到具有多余的行的行。进行差异测试，并找到具有最大自信差异的行。即使有许多缺失的值，也可以找到类似PCA的变化组件，即旋转，以便可以有意义地解释单个组件。支持延迟的矩阵和生物比较。

作者：保罗·哈里森[AUT，CRE]

维护者：Paul Harrison

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ weitrix”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Weitrix”）

html		1.概念和实用细节
html	R脚本	2. poly（a）尾巴长度示例
html	R脚本	3.替代聚腺苷酸化
html	R脚本	4. RNA-seq表达示例
html	R脚本	5.比例数据示例与SLAM-SEQ
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	datarepresentation，，，，维度，，，，基因表达，，，，rnaseq，，，，回归，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学
版本	1.9.0
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（2年）
执照	LGPL-2.1 |文件执照
要看	r（> = 3.6），总结性特征
进口	方法，utils，统计，grdevices，断言，，，，S4VECTORS，，，，延迟，，，，延迟的matrixstats，，，，生物比较，，，，生物基因，，，，林玛，，，，TopConfects，，，，dplyr，，，，purrr，，，，GGPLOT2，，，，rlang，，，，秤，，，，RESHAPE2，花键，ckmeans.1d.dp，，，，GLM2，，，，Rhpcblasctl
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，平淡无奇，，，，呼吸道，，，，EDGER，，，，ensdb.hsapiens.v86，，，，org.sc.sgd.db，，，，AnnotationDbi，，，，复杂的图像，，，，拼布，，，，测试（> = 2.1.0）
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	weitrix_1.9.0.tar.gz
Windows二进制	weitrix_1.9.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	weitrix_1.9.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/weitrix
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/weitrix
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/weitrix/
软件包下载报告	下载统计