TopConfects

doi：10.18129/b9.bioc.topconfects

这是发展TopConfects的版本；对于稳定版本，请参阅TopConfects。

最高自信的效果大小

生物导体版本：开发（3.16）

通过自信效应大小进行排名，同时保持虚假发现率和错误的覆盖范围控制率。TopConfects是对治疗结果的替代表现，具有提高的可用性，消除了P值，而是提供置信度范围。主要应用程序是差异基因表达分析，以自信的log2折叠变化顺序排名，但可以将其应用于与相关标准误差的任何效应大小的集合。

作者：保罗·哈里森[AUT，CRE]

维护者：Paul Harrison

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ topconconfects”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

BrowseVignettes（“ TopConfects”）

html	R脚本	TopConfects的概述
html	R脚本	自信的折叠更改
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	差异性，，，，基因表达，，，，多重组合，，，，rnaseq，，，，回归，，，，软件，，，，转录组学，，，，Mrnamicroarray
版本	1.13.0
在生物导体中	Bioc 3.9（R-3.6）（3年）
执照	LGPL-2.1 |文件执照
要看	R（> = 3.6.0）
进口	方法，utils，stats，断言，，，，GGPLOT2
链接
建议	林玛，，，，EDGER，，，，Statmod，，，，deseq2，，，，阿什，，，，NBPSEQ，，，，dplyr，，，，测试，，，，RESHAPE2，，，，花花公子，，，，readr，，，，org.at.tair.db，，，，AnnotationDbi，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用
系统要求
增强
URL	https://github.com/pfh/topconfects
BugReports	https://github.com/pfh/topconfects/issues
取决于我
进口我	metavolcanor，，，，Weitrix
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	topConfects_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	topConfects_1.13.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	topConfects_1.13.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/topconfects
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/topconfects
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/topconfects/
软件包下载报告	下载统计