qpgraph

doi:10.18129/b9.bioc.qpgraph

这是发展QPGraph的版本;对于稳定版本,请参阅qpgraph

从高通量基因组数据数据中估计遗传和分子调节网络

生物导体版本:开发(3.16)

从高通量表达和基因分型测定中估算基因和EQTL网络。

作者:Robert Castelo [AUT,CRE],Alberto Roverato [AUT]

维护者:Robert Castelo

引用(从r内,输入引用(“ qpgraph”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ qpgrgraph”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ qpgraph”)

PDF basicusersguide.pdf
PDF R脚本 使用QPGraph估算EQTL网络
PDF R脚本 使用QPGraph的反向工程转录调节网络
PDF R脚本 使用QPGraph模拟分子调节网络
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,结肠管制,,,,遗传因素,,,,遗传学,,,,GraphandNetwork,,,,微阵列,,,,网络引导,,,,途径,,,,SNP,,,,软件,,,,转录
版本 2.31.0
在生物导体中 Bioc 2.4(R-2.9)(13年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.5)
进口 方法,并行,矩阵(> = 1.0),网格,注释,,,,图形(> = 1.45.1),生物酶,,,,S4VECTORS,,,,生物比较,,,,AnnotationDbi,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,GenomicFeatures,,,,mvtnorm,,,,QTL,,,,rgraphviz
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,生物使用,,,,GeneFilter,,,,org.eck12.eg.db,,,,Rlecuyer,,,,,,,,类别,,,,gostats
系统要求
增强
URL https://github.com/rcastelo/qpgraph
BugReports https://github.com/rcastelo/rcastelo/issues
取决于我
进口我 快船
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 qpgraph_2.31.0.tar.gz
Windows二进制 qpgraph_2.31.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) qpgraph_2.31.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qpgraph
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/qpgraph
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/qpgraph/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户