PCAEXPLORER

doi：10.18129/b9.bioc.pcaexplorer

这是发展PCAExplorer的版本；对于稳定版本，请参阅PCAEXPLORER。

使用主要组件方法对RNA-SEQ数据进行交互式可视化

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包提供了基于主组件分析的RNA-Seq数据集的交互式可视化功能。提供的方法可以快速提取信息和有效的数据探索。闪亮的应用程序封装了整个分析。

作者：费德里科·马里尼（Federico Marini）[AUT，CRE]

维护者：uni-mainz.de>的Federico Marini

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ pcaexplorer”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ pcaexplorer”）

html	R脚本	PCAExplorer用户指南
html	R脚本	使用PCAExplorer启动并运行
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	维度，，，，GUI，，，，免疫学，，，，委托人，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，报告写作，，，，软件，，，，可视化
版本	2.23.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（6年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看
进口	deseq2，，，，总结性特征，，，，基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，GeneFilter，，，，GGPLOT2（> = 2.0.0），热图，，，，情节，，，，秤，，，，NMF，，，，plyr，，，，topgo，，，，林玛，，，，gostats，，，，go.db，，，，AnnotationDbi，，，，闪亮的（> = 0.12.0），发光的dashboard，，，，丝绸，，，，Ggrepel，，，，DT，，，，闪亮，，，，三j，，，，Biomart，，，，pheatmap，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，base64enc，，，，花花公子，grdevices，方法
链接
建议	测试，，，，生物使用，，，，呼吸道，，，，org.hs.eg.db，，，，htmltools
系统要求
增强
URL	https://github.com/federicomarini/pcaexplorerhttps://federicomarini.github.io/pcaexplorer/
BugReports	https://github.com/federicomarini/pcaexplorer/issues
取决于我
进口我	理想的
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	pcaexplorer_2.23.0.tar.gz
Windows二进制	pcaexplorer_2.23.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	pcaexplorer_2.23.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcaexplorer
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/pcaexplorer
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/pcaexplorer/
软件包下载报告	下载统计