马斯喀特

doi：10.18129/b9.bioc.muscat

这是发展Muscat的版本；对于稳定版本，请参阅马斯喀特。

多样本多组SCRNA-seq数据分析工具

生物导体版本：开发（3.16）

“ Muscat”在多样本，多组，多（细胞）亚群中提供了各种方法和可视化工具，用于DS分析，包括基于聚合的“ Pseudobulk”数据，包括细胞级混合模型和方法，例如以及模仿单样本和多样本SCRNA-SEQ数据的灵活仿真平台。

作者：Helena L. Crowell [AUT，CRE]，Pierre-Luc Germain [AUT]，Charlotte Soneson [Aut]，Anthony Sonrel [AUT]，Mark D. Robinson [Aut，FND]

维护者：Helena L. Crowell

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ muscat”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Muscat”）

html	R脚本	1. DS分析
html	R脚本	2.数据模拟
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	差异性，，，，免疫学，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，统计信息，，，，可视化
版本	1.11.2
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（2。5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.2）
进口	生物比较，，，，BLME，，，，复杂的图像，，，，Data.Table，，，，deseq2，，，，dplyr，，，，EDGER，，，，GGPLOT2，，，，glmmtmb，grdevices，网格，林玛，，，，lmertest，，，，LME4，，，，矩阵，，，，矩阵， 方法，进步，，，，purrr，，，，S4VECTORS，，，，秤，，，，评分，，，，砍伐，，，，sctransform，统计Singlecellexperiment，，，，总结性特征，，，，方差分区，，，，维里迪斯
链接
建议	生物使用，，，，countsimqc，，，，牛仔图，，，，实验室，，，，icobra，，，，尼特，，，，系统图，，，，rcolorbrewer，，，，RESHAPE2，，，，rmarkDown，，，，Statmod，，，，测试，，，，insctr
系统要求
增强
URL	https://github.com/helenalc/muscat
BugReports	https://github.com/helenalc/muscat/issues
取决于我
进口我
建议我	muscdata
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	muscat_1.11.2.tar.gz
Windows二进制	muscat_1.11.2.2
MacOS 10.13（高山脉）	muscat_1.11.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/muscat
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/穆斯喀特
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/muscat/
软件包下载报告	下载统计