fobitools

DOI:10.18129 / B9.bioc.fobitools

这是发展fobitools版本;稳定的发布版本,请参阅fobitools。

FOBI本体的操作工具

Bioconductor版本:发展(3.16)

一组工具与Food-Biomarker本体(FOBI)进行交互。生物意义的一组基本操作工具分析、图形和文本挖掘注释营养策略数据。

作者:波尔Castellano-Escuder (aut (cre)Cristina Andres-Lacueva (aut),亚历克斯Sanchez-Pla (aut)

维护人员:波尔Castellano-Escuder < polcaes gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“fobitools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“fobitools”)

HTML	R脚本	饮食文本注释
HTML	R脚本	简单的食物奥拉
HTML	R脚本	用例ST000291
HTML	R脚本	用例ST000629
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,BiomedicalInformatics,Cheminformatics,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,MassSpectrometry,代谢组学,通路,软件,可视化
版本	1.5.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1)
进口	clisymbols,蜡笔,dplyr,fgsea,ggplot2,ggraph,magrittr,ontologyIndex,purrr,RecordLinkage,stringr,textclean,发出滴答声,tidygraph,tidyr,发呜呜声
链接
建议	BiocStyle,covr,ggrepel,kableExtra,knitr,metabolomicsWorkbenchR,POMA,rmarkdown,房车,SummarizedExperiment,testthat2.3.2 (> =)tidyverse
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pcastellanoescuder/fobitools/
BugReports	https://github.com/pcastellanoescuder/fobitools/issues
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进口我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	fobitools_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	fobitools_1.5.0.zip(64位)
macOS 10.13(高山脉)	fobitools_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fobitools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ fobitools
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/fobitools/
包下载报告	下载数据