esetVis

DOI:10.18129 / B9.bioc.esetVis

这是发展esetVis的版本;稳定版请参见esetVis．

expressionSet Bioconductor对象的可视化

Bioconductor版本:开发(3.16)

用于expressionSet(或summarizeexperiment)生物导体对象可视化的实用函数，包括谱图、tsne和线性判别分析。可以通过ggplot2包进行静态绘图，也可以通过ggvis或rbokeh包进行交互式绘图。

作者:Laure counnaud < Laure。Cougnaud在openanalytics.eu>

维护者:Laure counnaud < Laure。Cougnaud在openanalytics.eu>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("esetVis")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“esetVis”)

超文本标记语言	R脚本	esetVis包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation，DimensionReduction，通路，PrincipalComponent，软件，可视化
版本	1.23.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(6年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	mpm，hexbin，Rtsne，中长期规划、网格Biobase，质量，统计，utils, grDevices，方法
链接
建议	ggplot2，ggvis，rbokeh，ggrepel，knitr，rmarkdown，所有，hgu95av2.db，AnnotationDbi，老鸨，SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	esetVis_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	esetVis_1.23.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	esetVis_1.23.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	esetVis_1.23.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/esetVis
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/esetVis
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/esetVis/
软件包下载报告	下载数据