装饰

doi:10.18129/b9.bioc.deco

这是发展DECO的版本;对于稳定版本,请参阅装饰

使用OMIC数据分析分解异质队列

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包通过两步方法(包括limma and NSCA)的两步方法发现了异质和均质imic数据中的差异特征。DECO揭示了与隐藏子类不仅与较高的放松管制水平相关的隐藏子类的功能关联。

作者:Francisco Jose Campos-Laborie,Jose Manuel Sanchez-Santos和Javier de Las Rivas。生物信息学和功能基因组学组。癌症研究中心(CIC-IBMCC,CSIC/USAL)。萨拉曼卡。西班牙。

维护者:francisco jose Campos Labie

引用(从r内,输入引用(“装饰”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ deco”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Deco”)

html R脚本 装饰
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,生物医学信息学,,,,聚类,,,,差异性,,,,exonarray,,,,特征提取,,,,基因表达,,,,MicroRNAARRAY,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,蛋白质组学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,转录组学,,,,Mrnamicroarray
版本 1.13.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(3年)
执照 GPL(> = 3)
要看 r(> = 3.5.0),AnnotationDbi,,,,生物比较,,,,总结性特征,,,,林玛
进口 统计,方法,GGPLOT2,,,,外国的,图形,生物使用,,,,生物酶,,,,,,,,GPLOTS,,,,rcolorbrewer,,,,Locfit,,,,制造4,,,,ADE4,,,,sfsmisc,,,,STACTPLOT3D,,,,gdata,grdevices,utils,RESHAPE2,,,,栅格
链接
建议 尼特,,,,策展,,,,多亚sayExexperiment,homo.sapiens,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/fjcamlab/deco
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 deco_1.13.0.tar.gz
Windows二进制 deco_1.13.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) deco_1.13.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/deco
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/装饰
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/deco/
软件包下载报告 下载统计

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  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户